1、小批量采购问题
小批量采购必然引起送货频率的增加，提高运输成本。对供应商来说，这是很为难的事情，特别是供应商在国外等远距离的情形下，实施JIT采购的难度就更大。可以通过混合运输、代理运输等方式解决，或尽量使供应商靠近客户等。具体来说，可以通过以下方法来解决小批量采购的问题：一是供应商在地理位置上尽量靠近制造商，如日本汽车制造商扩展到哪里，其零部件供应商就跟到哪里；二是供应商在制造商附近建立临时仓库（这其实是将库存负担转嫁给了供应商，并没有从根本上解决问题）;三是由一个专门的运输承包商或第三方物流企业按照事先达成的协议，搜集分布在不同地方的供应商的小批量物料，按时按量送到制造商的生产线上；四是让一个供应商负责供应多种原材料和外购件。
2、采购单源供应问题
采用单一的供应源也会给企业带来一些问题，如供应商可能因意外原因中断交货；企业不能得到竞争性的采购价格，使得企业对供应商的依赖性很大，有时候会处于被动地位等。为避免上述风险，很多企业常采用同一种原材料由两个供应商供货的办法，其中一个为主，另一个为辅。在实际工作中，许多供应商也不是很愿意成为制造商的单一供应源：一方面供应商是独立性较强的商业竞争者，不愿意把自己的成本数据披露给客户；另一方面供应商不愿意成为客户的一个原材料库存点（制造商将库存转移给供应商）,实施JIT采购，减少的是企业的库存，于是库存成本原先是在客户一方，现在转移到了供应商一方。企业应该考虑到供应商的这种忧虑，因此，企业与供应商之间必须逐渐磨合，与供应商建立长期互利合作的新型关系，这样才能达到双赢的目的，从而提高整体社会效益。